公司为小规模纳税人时取得的增值税发票，在转登记为一般纳税人后可以据此抵扣进项税额吗？

可以。

纳税人自办理税务登记至登记为一般纳税人期间，未取得生产经营收入，未按照销售额和征收率简易计算应纳税额申报缴纳增值税的，其在此期间取得的增值税扣税凭证，根据《国家税务总局关于纳税人认定或登记为一般纳税人前进项税额抵扣问题的公告》（国家税务总局公告2015年第59号）规定，可以在登记为一般纳税人后抵扣进项税额。

但需要注意的是：企业取得的增值税专用发票，需按规定由销售方纳税人开具红字增值税专用发票后重新开具蓝字增值税专用发票，公司应凭重新开具的蓝字增值税专用发票抵扣进项税额。